Le dimensioni fisiche del condensatore sono direttamente legate alle tensione massima che può sopportare, più sono "grossi" è maggiore è la tensione massima possibile, non intesa come valore assoluto ma come valore possibile perché comunque la tensione è un parametro produttivo e puoi trovare condensatori 0805 che arrivano a 50V e altri a 25V, o meno, perché così sono stati progettati, dipende anche dalla capacità.
Quale case scegliere dipende esclusivamente da due fattori, il primo la disponibilità come valore e tensione, il secondo dalle esigenze di miniaturizzazione.
Se devi montare a mano il circuito è meglio rimanere su 0805 o 1206, sicuramente non scendere mai sotto il 0603, se il circuito viene montato da un service, con gli appositi macchinari, allora scegli pure la dimensione minore possibile compatibilmente con i parametri richiesti.