Salut,
comme c'est un peu vague comme question ma réponse le sera tout autant. Comme l’Arduino est connecté sur un port USB/série et que l'on sait écrire et lire avec Debian et avec Arduino dans ce fameux port c'est donc possible. Maintenant tu parles de 'la console' qui n'est qu'un shell particulier il faudra donc un programme pour faire le lien et gérer la comm.
Une petite recherche sur Google nous donnes déjà quelques pistes intéressantes