Bonjour,
Les cartes arduino officielle ne sont pas fait pour des applications sur batterie.
Le hardware est très consommateur même au repos (chipset usb, leds, ampli op, deux régulateurs non LDO (5 et 3v3), ATmega classique (pas basse conso), ...)
Ajoutez à cela un style de codage "brute" sans utilisation du mode sleep et de la gestion des périphériques inutile, il n'est pas anormale que la batterie est duré 12h 
Tu peut regarder du côté des cartes olimexino :
Qui supportent le fonctionnement depuis une batterie Lipo (de modélisme) avec une électronique basse consommation.