Come dice Pelletta, hanno scopi diversi.
I condensatori da 100nF hanno prevalentemente una funzione di antidisturbo, per evitare oscillazioni etc etc, oltre a piccola riserva di carica
Gli elettrolici hanno una funzione di riserva di energia. Che e' indispensabile nel caso ad esempio di componenti che hanno bisogno di corrente in tempi brevi.
Ad esempio il rele' che menziona pelletta crea due problemi, dei picchi di disturbo creati dalle extratensioni generate dal carico induttivo della bobina ( e si risolve mettendo dei 100nF vicino agli integrati ) e di caduta di potenziale nei pressi del rele' ( e si risolve inserendo degli elettrolitici vicino al componente a cui serve energia )
Nel caso degli RTC, il condensatore elettrolitico ha una sua funzione se si tratta di una schedina separata. dato che chi lo progetta non sa' a priori quanto sara' lungo il collegamento tra RTC e Microcontrollore, inserisce un elettrolitico per sicurezza.
Se non ci sono questi problemi di lunghezza dei cavi, basta un semplice 100nF.