In der Regel schreibt man es schon in Code.
Bei größeren Matrizen / komplexen Effekten ist Glediator beliebt.
Was willst Du denn konkret machen?
Kannst ja mal hier schauen, das habe ich letzte Woche für eine RGB Matrix geschrieben: https://www.youtube.com/results?search_query=stefan+petrick
Wenn Du Fragen zu Effekten oder zum grundsätzlichen Vorgehen hast - her damit!
Hast Du schon eine lib gefunden, um Deine Pixel einzeln anzusteuern?
Grüße
Helmuth
edit: Schau mal hier http://www.instructables.com/id/LED-Matrix-with-Arduino/?lang=de
edit2: Mit nur einer Farbe, bei der Du die PWM auch noch selbst schreiben musst (falls Du Wert auf mehr als an/aus legst), kann man nicht sooo viel machen... Kennst Du die hier: http://img.alibaba.com/img/pb/912/635/646/646635912_352.jpg
