Du meinst den Ventillator des Kühlerwassers des Motors?
Ich sehe da ein anderes Problem. Auch wenn Du den Lüfter laufen läßt bekommst Du das Lufterwasser nicht kalt da die Kühlwasserpumpe nicht läuft weil die meisten Autos die Kühlwasserpumpe über die Motorwelle antrieben. Du kühlst zwar das Wasser im Kühler, aber nicht im Motor.
Ansonsten ist die Steuerung über Arduino möglich aber abzuwägen ob die Zuverlässigkeit des Systes nicht leidet und Du einen Motorschden reskierst, weil der Arduino abgestürzt ist. Die Elektroinstallation in Autos ist wegen der Zündspule sehr RF gestöhrt.
Grüße Uwe