Ich würde Dir den Wechsel zum Wemos D1 mini pro empfehlen. Der hat den USB-Anschluß gleich dran.
Evtl. könnte auch ein Wechsel zur Version 2.3.0 der ESP8266-Software helfen. Die 2.4.0/1 hat noch einige Bugs.
Dazu ist eine portable Installation der IDE ganz praktisch. Davon kann man mehrere betreiben mit eigenen Libs/Versionen.
Gruß Tommy