Finalmente sono arrivato a due, ma...

#include <LiquidCrystal.h>
#include <Time.h>  
#include <Wire.h>  
#include <DS1307RTC.h>  // a basic DS1307 library that returns time as a time_t

int ledPin3 = 8;     // pin led lunare
int ledPin = 9;      // LED prima fila connessi al pin 9
int ledPin4 = 6;     // pin led uv, red, gree, blu
int ledPin2 = 10;    // LED seconda fila connessi al pin 10
int analogPin = 2;   // potentiometer connected to analog pin A2
int analogPin2 = 1;  //secondo potenziometro connesso al pin A1
int val = 0;         // variable to store the read value
int val2 = 0;        // variabile per il secondo potenziometro

LiquidCrystal LCD(12,11,5,4,3,2);

void setup()
{
  Serial.begin(9600);         //inizializza la comunicazione seriale tra Arduino e pc per trasferire i dati da 'stampare' sul monitor
  pinMode(analogPin, INPUT);  // setta il pin come ingresso
  pinMode(ledPin, OUTPUT);   // sets the pin as output
  pinMode(ledPin2, OUTPUT);  // output pin 2
  pinMode(ledPin3, OUTPUT); // uscita led lunare
  LCD.begin (16,2);
  setSyncProvider(RTC.get);   // the function to get the time from the RTC
  if(timeStatus()!= timeSet) 
    Serial.println("Unable to sync with the RTC");
  else
    Serial.println("RTC has set the system time");     
}

void loop()
{
  LCD.setCursor(0,0);
  digitalClockDisplay();  
  delay(1000);

  int pinState = analogRead(analogPin);
  val = analogRead(analogPin);   // read the input pin
  Serial.println(100 - pinState / 10); //scrive la percentuale di potenza utilizzata dai led
  delay(1); // intervallo di un ms dopo la scrittura
  if (val >= 980)
  {
    digitalWrite (ledPin, HIGH);
  }
  else
  {
    analogWrite(ledPin, val / 4);  // analogRead values go from 0 to 1023, analogWrite values from 0 to 255
  }
  if (val >= 980)
  {
    digitalWrite (ledPin2, HIGH);
  }
  else
  {
    analogWrite(ledPin2, val / 4);  // analogRead values go from 0 to 1023, analogWrite values from 0 to 255
  }
  if (val >= 980)
  {
    digitalWrite (ledPin4, HIGH);
  }
  if (val <= 979 or val >= 650)
  {
    analogWrite (ledPin4, val / 4);
  }
  else
  {
    analogWrite(ledPin4, val / 4 + 10); //per avere un pò meno potenza nella fila dei led colorati faccio passare un pò meno corrente 
    //quindi se agli altri arriverà 100 quiverà fatto passare 90 cioè 100-10
  }                   

  {
    val2 = analogRead(analogPin2);

  }
  val = analogRead(analogPin);
  if (val >= 800)
  {
    digitalWrite (ledPin3,HIGH);
  }
  else
  {
    digitalWrite (ledPin3, LOW);
  }

}

void digitalClockDisplay(){
  // digital clock display of the time
  LCD.print(hour());
  printDigits(minute());
  printDigits(second());
  LCD.print(" ");
  LCD.setCursor(0,1);

  LCD.print(day());
  LCD.print(" ");
  LCD.print(month());
  LCD.print(" ");
  LCD.print(year()); 
  LCD.println(); 
}

void printDigits(int digits){
  // utility function for digital clock display: prints preceding colon and leading 0
  LCD.print(":");
  if(digits < 10)
    LCD.print('0');
  LCD.print(digits);
}

Mancandomi le librerie non posso controllare se compila e se funziona.
Ho semplicemente unito i due sketch e le funzioni setup e loop che devono essere uniche.