Du brauchst nur eine Freilaufdiode pro Motor. Diese wird parallel zum Motor in Sperr-Richtung (Kathode an Plus, Anode an Minus) eingesetzt.
Der Motor enthält relevante Induktivitäten (Spulen), die einen Anlaufstrom speichern und ihn beim Ausschalten wieder abgeben. Dieser zurückfliessende Strom wird über die Dioden verbraten, bevor er in der Schaltung Schaden anrichten kann.