Re,
Si tu regardes la data sheet transmise en lien, tu verras que le Imax de ta diode est 50 mA (Attention les sorties de ta carte ne supportent pas ce courant. Tu verras également que la tension de seuil est d'environ 1.2V (voir les données numériques et les courbes).
Supposant que tu veilles un courant de 10 mA à travers ta diode, ce qui sera amplement suffisant.
Tu auras R = (5 - 1.2) / 10 = 0.38 kOhm soit en valeur de la série E12 R = 390 Ohm
Ta valeur de 1 k permettra également d'allumer ta diode. 
Dans certains cas l'électronique et la médecine ne sont pas toujours des sciences exactes ]