Sinceramente nunca me ha funcionado el modo de compatibilidad del W7. 
Como estos programas se basan en el hardware (puertos) aún menos. Ya los he probado.
Voy a ver si desempolvo un viejo disco que tengo, lo coloco en el ordenador y le instalo un XP, aunque realmente en la especificación dice que funcionan hasta W98 y este creo que ya es imposible instalarlo en mi máquina. Y para más inri no puedo virtualizarlo porque la BIOS no lo soporta. 
Y desde luego que sà que se podrá grabar con un ISP para AVR con USB y también usando el Arduino Uno como programador ISP, pero por más que leo información (sobre todo hay para el ATtiny) no me aclaro con las conexiones tanto del ISP, como con el Arduino Uno como ISP.
Como he comentado voy a buscar la opción de usar el AT del Arduino, en vez del 2313 por lo que tengo que adaptar el código (aunque más que adaptarlo, rehacerlo). Pero no dejaré de intentar esto. He pedido ya varios 2313 por si frÃo (seguro ) alguno, tener en la reserva.
Iré informando si consigo algo por si a alguien le sirviera.
Muchas gracias por la ayuda y la información proporcionada.