Doch, die Spannung an AREF spielt eine Rolle!
Die kann man nur ignorieren, wenn du eine ratiometrische Messung hast, also eine Reihenschaltung von Vorwiderstand und Sensor, die aus eben der AREF gespeist wird.
Hier hast du aber eine externe Spannungsquelle, die 2% Genauigkeit der Arduino-Versorgung geht also voll ein.
Die Frage ist, ob die 2% stören.