Hola, impresionante proyecto ... espero que compartas fotos del diorama.
Respecto al controlador a usar, a mi me gusta mucho más el Leonardo que el Uno, aunque para el Uno haya disponibles más
A mi me gusta mucho más el Leonardo: su doble puerto serie te da mucho, mucho, juego (como por ejemplo, poder usar un transmisor/receptor de 433Mhz, que valen dos duros, para controlar distintas partes del diorama sin necesidad de tender cables).
(Y si me aprietas, me gusta más el VInciduino, producto de la casa, como quien dice, y bastante bien diseñado).
Por ultimo, con respecto al driver para los motores: ¿20€ por placa no es demasiado? Creo que hay drivers por ahí mucho más baratos, y necesitarás varios ...
Un saludo,
David