how to get the 1Msps in Due

Try this code, ADC and DAC in Free Running mode:

/*******************************************************************/
/*  Free Run ADC conversions of 1 analog input (A0)                */
/*  Free Run DAC output on channel 1 (DAC1)                        */
/*******************************************************************/

void setup()
{
  pinMode(LED_BUILTIN, OUTPUT);
  adc_setup();
  dac_setup();

}

void loop()
{

}

/*************  Configure adc_setup function  *******************/
void adc_setup() {

  PMC->PMC_PCER1 |= PMC_PCER1_PID37;                    // ADC power ON

  ADC->ADC_CR = ADC_CR_SWRST;                           // Reset ADC
  ADC->ADC_MR |=  ADC_MR_TRGEN_DIS                      // Hardware trigger disable
                  | ADC_MR_FREERUN
                  | ADC_MR_PRESCAL(0);                  // Or PRESCAL (1) to limit to 21 MHz !

  ADC->ADC_ACR = ADC_ACR_IBCTL(0b01);                   // For frequencies > 500 KHz

  ADC->ADC_IER = ADC_IER_EOC7;                          // End Of Conversion interrupt enable for channel 7
  NVIC_EnableIRQ(ADC_IRQn);                             // Enable ADC interrupt
  ADC->ADC_CHER = ADC_CHER_CH7;                         // Enable Channel 7 = A0
}

void ADC_Handler() {
  static uint32_t Count;
 
  DACC->DACC_CDR = ADC->ADC_CDR[7];                    // Reading ADC->ADC_CDR[i] clears EOCi bit
  
 // For debugging only
  if (Count++ == 1000000) {
    Count = 0;
    PIOB->PIO_ODSR ^= PIO_ODSR_P27;
  }

}

/*************  Configure adc_setup function  *******************/
void dac_setup ()
{

  PMC->PMC_PCER1 = PMC_PCER1_PID38;                   // DACC power ON

  DACC->DACC_CR = DACC_CR_SWRST ;                     // Reset DACC
  DACC->DACC_MR = DACC_MR_TRGEN_DIS                   // Hardware trigger disable, Free Run mode                
                  | DACC_MR_USER_SEL_CHANNEL1         // select channel 1
                  | DACC_MR_REFRESH (1)
                  | DACC_MR_STARTUP_8
                  | DACC_MR_MAXS;

  DACC->DACC_CHER = DACC_CHER_CH1;                   // enable channel 1 = DAC1

}