Microchip PIC conseille l'environnement MPLAB pour ses processeurs, ses bibliothèques sont donc parfaitement adaptées dans ce sens. A partir du moment où tu sais programmer en C je ne vois vraiment pas quel intérêt tu peux trouver dans l'environnement Arduino. Dans le milieu industriel utiliser l'IDE du constructeur est un gage de qualité et de maintenabilité.
Avant de chercher des solutions qui partent dans tous les sens as-tu installé MPLAB et codé la liaison 18F46K22/DS1307 à partir des bibliothèques MPLAB?