Oui, bien sûre, mais encore faudrait-il qu'un langage bien moins utilisé t'apporte la solution 
Il n'y a pas de vérité absolue, mais j'aurais tendance à penser que si tu ne trouves pas de solution avec une librairie C, j'ai du mal à croire que tu en trouve plus dans un autre langage.
Par définition tout microcontrôleur est fait pour l'industrie, Arduino ne produit aucun microcontrôleur !
J'ai l'impression que tu confonds deux choses, l'environnement Arduino et le matériel quel utilises.
L'environnement Arduino est constitué d'une couche logiciel, puis d'une surcouche(bibliothèque) plus ou moins sérieuse(amateur et professionnel) pour différent composant électronique(ex DS1307)
MCC à l'air d'être ce que tu recherches et proche de la philosophie Arduino.
L'outil graphique te faisant automatiquement du code pour toi.
Mais si MCC ne te plais pas, tu dois pouvoir utiliser la librairie Foundation Services qui est utilisée par MCC.
Je crois que la documentation ce trouve ici
Au passage tu as prévus une remise à l'heure régulière car le composant DS1307 est connue pour avoir une dérive de l'ordre de 1min ou plus par moi en fonction du quartz que tu va utiliser?