Nei repo di una distribuzione vengono messi sempre i software alla versione stabile più recente al momento del freeze della distribuzione stessa, prima del rilascio finale. Nel caso di Ubuntu LTS, quindi con supporto a lungo termine, vengono inserite anche alcune versioni aggiornate, ma generalmente dei software più diffusi quali Firefox, Openoffice e simili, e non è detto che poi in esso ricadano quelle più recenti in assoluto. Bisogna infatti vedere come siamo messi a dipendenze, stabilità, ecc..
Comunque per l'Arduino puoi usare qualsiasi versione, basta che ti scarichi quella che vuoi dal sito, la scompatti, ti installi le dipendenze a mano e poi iniziare ad usarla da subito. Io non ho mai messo quella dei repo della mia distribuzione né mi sono "dimenticato" se non la trovavo aggiornata.