se si ha la possibilita di scegliere tra fare una shield ed un progetto tutto integrato qual'e è la soluzione migliore?
es se devo fare lo stampato per dei voltmetri o un timer col le cifre a 7 segmenti
quale sarebbe la cosa piu giusta? fare una shield da mettere sopra un arduino originale/autocostruito
oppure fare un solo sampato compreso di tutto (cosi si risparmiano i connettori ma si incasinano i collegamenti)
io ti consiglio un pcb con tutto integrato..circuito+ atmega standalone..
così risparmi l'arduino..l'arduino lo usi quando è il momento di provare se funziona, poi il circuito definitivo conviene farlo tutto integrato 
anche a me all'inizio era venuta questa "idea" pero a pensarci bene non e che si risparmia troppo
perche l'atmega il quarzo ecc ci vanno sempre sia su un circuito stampato piu grande che su 2 piccoli
a parte le file dei connettori e qualche cm di vetronite non si risparmia nulla
A progetto concluso, sempre meglio fare una scheda ad Hoc.
E poi un ATmega va' anche senza quarzo ( max 8Mhz ) e in tante applicazioni non e' indispensabile.
Con 5-6 euro uno standalone te lo fai
GINGARDU:
anche a me all'inizio era venuta questa "idea" pero a pensarci bene non e che si risparmia troppoperche l'atmega il quarzo ecc ci vanno sempre sia su un circuito stampato piu grande che su 2 piccoli
a parte le file dei connettori e qualche cm di vetronite non si risparmia nulla
Spazio lo risparmi, in altezza sicuramente se eviti di fare il sandwich; comunque se si tratta di pochi componenti e non ti piace fare i bcb in casa valuta una protoshield.
Se invece fai il pcb con tutto ti avanzerà l'arduino, rimetti un atmega nuovo e sei pronto per partire con prossimo progetto.
Personalmente faccio sempre pcb con tutto, non per risparmiare ma perchè mi rilassa 
mah a pensare bene se proprio non e un progetto super-semplice con 3 led e 3 transistor,
è meglio fare la shield/doppia schedina, che poi se uno vuole le può fare tutte e due le piste su una
scheda sola visto le piccole dimensoni, poi la taglia in 2,
questo perche visto che siamo "hobbisti" dobbiamo stare sugli stampati a faccia singola il più possibile,
e con 2 schedine le cose si semplificano un pò se ci sono "troppe" piste
si ma guarda che lo schema per l'atmega standalone non è lo stesso dello schema dell'ARduino, è moooolto più semplice..
per un atmega standalone ti bastano il chip, una resistenza da 10kohm e opzionali un quarzo e due condensatori...quindi lo schema sta benissimo su una faccia... poi naturalmente vedi te, ma se ogni progetto che fai devi lasciare li l'arduino ne devi comprare un camion 
ma perche?
un arduino stand alone non puo starsene tranquillamente sotto su una basetta piu grande co 2 file di pin