Ok ya hice la prueba en protoboard y no registro ningun dato adicional el booleano no causa conflicto si no lo uso con codigo adicional de envio de datos, entonces la falla esta en el codigo de envio de datos o algun componente de la PCB que este generando una interferencia.
En la PCB hice una prueba con un nuevo arreglo de %5 y se registraron dos en el sensor tan solo en una linea de 286 que se registraron y deben ser 288. (En esta incluyo codigo de envio de datos)
if ( ((now.minute()%5)==0) && (now.second()==0))
Cuando uso con el for y sin %5 (se registran 287 lineas y cero falsa interrupcion en sensor)
En esta incluyo codigo de envio de datos y uso la PCB.
for (byte i = 0; i < 12; i++)
{
if ((now.minute() == min_registro[i]) && (now.second() == 0)) // Compara la hora del RTC con el ciclo de medicion