jackwatt:
...
qual'è fra questi la strada migliore per integrare le comode librerie arduino disponibili ...
Ho idea che non hai molta scelta se vuoi tutte le comodità di Arduino (molte cose nascoste, librerie pronte, ecc. ecc.) ...
... o l'IDE nativo
... oppure Atmel Studio con l'aggiunta di VisualMicro al quale, in aggiunta ed a pagamento (una modesta cifra), puoi collegare il suo debugger.
Guglielmo