Integrazione Arduino Udoo

si ma la Udoo ha il suo ide e dalla sua interfaccia grafica riesco a scrivere compilare e caricare... il problema che io vorrei non dover usare la parte grafica ma scrivere il sorgente su un qualsiasi PC mandarglielo e poi a quel punto complilarlo e caricarlo.....il mio problema sta nella complilazione perchè se gli mando un file gia compilato con il comando di prima funziona