Nur mal zwei Gedanken:
Haste die Shift-Register und weitere Teile vll alle am Arduino hängen, dass es da eng wird?
Brauchst du vll Widerstände zw. den Shiftregistern und dem Array?
Vll haste noch nen Bild vom Aufbau, so ist nat. schwer zu sagen, bzw nen Fehler in der Beschaltung schwer zu erkennen.