Très bien C# si c'est pour rester sous Windows (à moins d'utiliser GtkSharp pour avoir une interface utilisateur tournant aussi sous Unix et MacOS).
De toutes façons, tous les langages sont aptes à permettre des échanges entre un PC et un l'arduino donc le choix du langage est vraiment personnel je pense. Si tu aimes C# fait toi plaisir 
Perso je reste en C ou C++ et quand je veux une interface graphique un peu de GTK mais c'est, a ce niveau, kif kif et bourricot, juste une préférence/habitude perso