Vermutlich hängt die LED des Sensors mit am Ausgang und zieht damit den Ausgang des Sensors hoch.
Ich würde zuerst noch einen Test mit einer 1N4148 oder ähnlicher Diode machen. Ausgang des Sensors auf die Kathode der Diode, der Eingang des D1 an die Anode und den PullUp im D1 aktivieren. Der Sensor kann dann den Eingang nur gegen GND ziehen.
Gruß, Jürgen