hola.
mira te paso algunos ejemplos de arduino y serial. a mi me sirvieron para algunos proyectos. basicamente es utilizar el serial.begin para iniciar comunicacion, el if (Serial.available() > 0) para realizar acciones si el serial contiene datos.. y por ejemplo int inByte = Serial.read() para guardar el dato en la bariable inByte de lo que se lea por el serial
ejemplo para controlar servo por serial: http://assemblersfive.tapachulaenlinea.com/2011/11/16/controlar-arduino-desde-el-teclado-de-una-computadora/
otro que esta bueno similar: http://www.sherkhan.net/blogs/frikadas/?p=153
son ejemplos buenos.
no se que deseas hacer. pero cosas como x.sim y arduino tengo bastante info. y algunos ejemplos posteados en este foro.
espero te sirva para analizar.
saludos