si piensas que es por el tamaño, aunque a mi me extraña, porque no creas un programa grande y pruebas? aunque sea con código repetitivo y sin sentido, pero bien escrito.
puedes poner un Serial.println("asañldkfjasdkfjaskdj"); una y otra vez. y mas código de este tipo.
aunqe yo creo que el problema no es el tamaño del sketch sino de las librerias. puedes probar a ir añadiendo librerias a tu sketch hasta que falle.