Tja und da verließen sie auch mich....
Die Ausgabe sieht sehr vernünftig aus. Die Fuse Settings entsprechen dem Boards.txt File für den Mega. Die Verbindung zwischen Programmer und Chip ist also auch OK.
Leider weiß ich momentan jetzt auch nicht mehr weiter. Sorry.
Mach das ganze nochmal mit angeschlossenem Programmer und dem Blink Sketch und schau dann mal die Debug Ausgabe an.