Testato:
Cosa c è di diverso tra R1 e R3 ? Ci sono firmware diversi nel 8u2 delle due versioni ?
Ci sono circuiti diversi per la gestione del reset (lo hai riportato anche nella tua guida 
), c'è un chip differente (la UNO R1 usa l'Atmega8U2 mentre la R3 usa l'Atmega16U2).
La modifica sarà applicabile alla Leonardo con qualche modifica ?
A che ti serve? La Leonardo gestisce il reset in maniera diversa e funzionante.