Hallo,
Wenn man den Geist ruft. 
Nicht gab, den Thread gibt es immer noch. 
nano-every-atmega4809-am-anfang-stand-der-anfang
Ich lese du möchtest irgendeine Frequenz haben und den Duty Cycle einstellen.
Von welcher Frequenz oder Frequenzbereich reden wir?
Von welchen Duty Bereich reden wir?
Vielleicht ist im Link schon etwas dabei.
Die Verwendung vom MegaCoreX Core empfehle ich jedem Every Nutzer. MCUdude war so schlau und hat den Timer TCA freigeschaufelt. Wird nicht mehr von millis() & Co belegt. Könnte wichtig werden.