Olá.
Não vejo que tenha declarado o pino 13 como saída e, além do mais, costumo evitar esse pino por estar associado ao led da placa, nada precisa acontecer, mas não gosto.
Você não indica como controla o motor, sabe quanto ele consome? Pode ser que você tenha que acioná-lo com um transistor. Você colocou um diodo Flyback para evitar que o FEM passe para o arduino? Talvez você deva colocá-lo, se não o fez.
Saudações.