Ho usato un Mac, non Linux. Per i warning, al momento non sono a casa per cui non so dirti.
Se non c'è un ambiente di sviluppo, ed il supporto per gli Avr è limitato, questo rtems mi cade un pò d'interesse. 
Diciamo che non ho molta voglia di imparare ad usare l'ennesimo blocco di strumenti e di classi con i loro metodi e tutto quel che ne deriva, per poi arrivare ad una cosa che forse userò 1 volta giusto per far lampeggiare 2 led in contemporanea come ho già fatto per altri RTOS in passato 
Magari tu hai un interesse diverso, avendo una scheda ST e cercando un RTOS da sfruttare ma io al momento non uso altro che Atmel AVR (tranne dei test fatti mesi fa con i PIC) per cui non so come questo rtems possa essermi d'aiuto