Merci pour cette précision !! Je n'avais pas vu les broches qui étaient à coté de AREF. Cependant, j'avais laissé en place le module Ethernet pour garder la partie Web, mais après avoir enlevé tout ce qui était connecté sur l' Arduino pour ne me focaliser que sur le DS1307, je me suis aperçu que cela fonctionnait !!
Le problème venait de la patte du module Ethernet SCL à côté de AREF qui n'était pas rentrer sur la Mega, et qui je pense rendait impossible toutes connexions i2c, que se soit les broches SDA/SCL dispo soit en D20/D21 soit à coté a AREF.
Désolé pour cet incident 
Merci en tout cas pour votre implication à tous...