Li puoi usare con i normali comandi digitalRead e digitalWrite nominandol con le sigle a0, A1, ecc ecc.
Esempio:
digitalWrite(A3, HIGH);
oppure
byte PulsanteB = digitalRead(A2);
Ricordati che se usi periferiche I2C, come RTC, LCD, ecc non puoi usare i pin A4 e A5 perché riservati da quella funzione, altrimenti vanno in conflitto.