A prima vista uno sketch Arduinico può girare sulla Intel apparentemente allo stesso modo che su un Arduino vero.
Ci sono però delle sottili differenze. Primo, non c'è un Arduino sotto ma un emulatore che intepreta il codice Arduinico e lo trasforma in istruzioni eseguibili dal SoC di Intel. Poi, la gestione delle linee di I/O è totalmente differente: le linee sono multiplexate e la corrente massima erogabile è inferiore. Uno sketch che pilota un certo HW sfruttando i limiti fisici dell'Arduino quasi sicuramente non funzionerà sulla Intel (considera che la Intel può erogare 10 mA su un pin, l'Arduino fino a 40 mA9. I canali ADC hanno una risoluzione di 12 bit contro i 10 dell'Atmega. Non so poi se vai ad usare timer o interrupt cosa succede...
Insomma, le schede non sono uguali.
Insomma, non perché sono 2 macchine fotografiche, una Leika è identica ad una Canon.