Dipende da cosa vuoi realizzare... in tanti casi, è inutile lasciare il bootloader, programmalo direttamente.
Dipende da cosa vuoi realizzare - bis: le certificazioni dipendono dall'uso del dispositivo, una cosa è l'uso in un impianto domestico, altra cosa è l'uso in un sistema industriale, altra cosa è l'uso in una centrale a fissione...
Dipende da cosa vuoi realizzare - ter: se crei una shield, puoi anche usare un sistema di certificazione minimo, in quanto in questi casi l'uso è per esperimenti amatoriali che rimangono sul tavolo o fungono da base per progettare le fasi ulteriori.