In realta' ... Neutro - Fase, tra di loro c'e' una differenza di potenziale alternata... puoi invertirle senza problemi.
Non è proprio così, il conduttore di "fase" è quello su cui passa l'onda sinusoidiale effettiva a 50 Hz 230V, mentre il "neutro" è il ritorno a potenziale ZERO (in teoria in un impianto ben fatto si potrebbe anche toccare senza prendere la scossa...ovviamente, per sicurezza, NON fatelo!!).
Invertire i conduttori quando non c'è un trasformatore di mezzo (come nel nostro caso) fa una bella differenza eccome!! Ad esempio nel tuo schema corrisponderebbe ad applicare direttamente una sinusoide con picchi di oltre +/- 300v direttamente sul piedino Gnd dell'ATMega. E non è quel che si dice..."tutta salute"!