Estaría bien que alguien entendido pusiera la respuesta definitiva, porque yo también creo que es como dice Lisergio; es decir que por el VIN sólo se puede alimentar con 5V o bien, si se ha alimentado por el jack con 7-12V, pasan por el regulador del arduino para convertirse en 5V disponibles también para otros dispositivos a través del pin VIN.
Lo que no estoy muy seguro, es qué ocurre con la alimentación (usb, jack, vin) si se utilizan dos o las tres) a la vez.
Saludos.