Complimenti a te, anche se sono molto incuriosito dal comportamento del tuo 328-AU, proprio in questi giorni sto sperimentando svariate tecniche di programmazione (con bootloader e senza) su microcontrollori non arduinici con risultati estremamente incoraggianti, tra questi c'è ovviamente anche il 328, in entrambe le versioni -PU e -AU e non ho avuto alcun problema.
L'unica cosa che mi ha sorpreso del tuo test è stato il fatto che ti è bastato togliere la "p" finale alla riga MCU per riuscire a caricare il bootloader, mentre in realtà avresti dovuto aggiornare il file AVRDUDE.CONF, come spiegato nella mia mini-guida, cosa che io ho dovuto necessariamente fare nonostante avessi aggiornato la toolchain ATMEL all'ultima versione.
Ciao e complimenti ancora!