Por lo aue describes, si hay continuidad entre los pines 10 y 11, pues eso no es buen síntoma. Es mas si los usas y entran en corto, es muy posible que fundas los puertos del AVR. Te aconsejo que mires con una lupa los pines del micro para ver si hay algún resto de soldadura. Mira a ver si tienes continuidad con tierra, porque podría ser posible que el PCB este mal fabricado.
A6 y A7 son entradas analógicas puras en el AVR, no estan conectadas a ningún buffer de entrada salida y van directamente al mux (selector de canal) del módulo analógico.