Quel codice era di esempio, è scritto per l'Atmega328. Devi prendere il datasheet dell'Atmega2560 e vedere quali sono i registri corrispondenti.
A "naso" mi sento di dirti che se usi Serial1, può darsi che sia il registro UCSR1A ed il bit TXC1, ma non posso confermare senza vedere la documentazione. Quindi, controlla tu 