Das wäre mir neu.
Auch GPIO12, GPIO13 und GPIO14 sind normale GPIOs, wenn die nicht gerade als SPI genutzt werden. Damit können die auch für deine Anwendung genutzt werden.
Dein eigentliches Problem liegt vermutlich an den Pins GPIO0 und GPIO2 die beim booten nicht extern beschaltet sein sollten.
Und wenn du die als Ausgang auf HIGH schaltest.