... bravo ... vedi che stando attento ti accorgi da solo di cose errate 
Due cose fondamentalmente ...
... non puoi usare millis() perché devi misurare tempi che sono di µsec ... quindi ... micros()
... metti il pin in INPUT, leggi i micros() e li salvi, fai il WHILE (il pin è HIGH) e quando esci dal WHILE (ovvero quando il pin diventa LOW) rileggi micros() e fai la differenza con il valore che avevi salvato e sai ... i µsec che sono passati.
Ricorda che 1000 µsec = 1 millisec
Guglielmo