Un truc a essayer. Supprimer les 2 LED sur le capteur et alimenter celui-ci par une broche de l'arduino. Le LM393 ne consomme pas grand chose à lui tout seul. Ainsi tu pilotes quand tu veux l'alimenter.
Le capteur fonctionne avec une alimentation comprise entre 3,3 et 5V donc cela devrait faire l'affaire. S'assurer quand même que le système n'est pas trop sensible à la qualité de la tension délivrée par un I/O.