Je te conseille plutôt Sqlite que Mysql: tu fais de l'embarqué, tu n'est pas sur un serveur de course. Ca reste du Sql donc tu ne seras pas dépaysé.
Au niveau langage, ça fonctionnerait comme ça:
- gestion des capteurs / actionneurs en Python, qui est capable de s'interfacer avec la base de données
- interface Web utilisant éventuellement Php pour les accès à la base de données, mais personnellement j'aurais plutôt tendance à tout faire en Python en utilisant Flask (http://flask.pocoo.org/)
Pour ce qui est du RFID, tout dépend de l'interface proposée par le module que tu va utiliser. Tu as déjà vu des choses sur le sujet ?
De mon côté je travaille actuellement sur de l'identification animale par RFID et j'utilise un module avec une liaison série, donc il me suffit de le connecter sur le port USB sur ma carte de contrôle (une Beaglebone Black) via un convertisseur série / USB. La lecture se fait en Python grâce à la bibliothèque Pyserial. Tu peux trouver d'autres solutions d'interfaçage en fonction des modules, je te donne simplement cet exemple pour que tu vois à quoi ça peut ressembler.