Per scelta ho smesso di usare WINE da molto tempo (se volevo usare software per Windows, continuavo a tenermi Windows). Comunque AvrStudio non è indispensabile per scrivere uno sketch che usa i timer. Basta un editor, se si sa cosa fare 
Ad esempio le mie librerie io le ho scritte usando un semplice editor multilinguaggio, Geany (per capirsi, equivale a Notepad++ su Windows).