En cuanto al RTC 3231 indiscutible yo tambien lo uso, el buzzer yo uso uno activo controlado por un transistor, (2n2222), pero si es inactivo con la funciom tone no tendrias problemas.
En cuanto a los displays , sinceramente , para un prototipo de aprendizaje valen, pero si vas a utilizarlo como un reloj fucional te vas a dejar los ojos mirando el LCD , (muy pequeño para ver de lejos),
Una posile solución seria usar esto
Y te podria quedar mas o menos asi:
A eso le añades una LDR para cotrolar el brillo , unos cuantos pulsadores , (te ahorarias el segundo display 7 sementos) , pulsado uno de ellos te mostraria la alarma en la msma matriz de led. Y un modulo pir para que solo se encieenda cuando detecte presencia animal,( ahorro de energia ), creo que tendrias un buen despertador para la mesita de noche.