Veramente una volta scritto il programma nella flash, siano a quando non ci riscrivi sopra rimane li in modo permanente, quindi ... NON capisco il tuo problema :
L'unica cosa che si cancella in mancanza di alimentazione è la SRAM (... dove sono le variabili), ma questo è ininfluente dato che al riavvio, il programma riparte dall'inizio.
Guglielmo