J'ai la réponse à la question 2 (où trouver les sources d'un module ch341 fonctionnelle pour ma debian stretch) :
réponse : dans les sources de la version du noyau 4.17-rc4 (dernière version distribuée à ce jour sur kernel.org)
Des corrections ont été faites sur le module ch341 entre la version du noyau (4.9) fournie avec la debian stable et la version actuelle.
Il faut donc recompiler le module ch341 si l'on est sous debian stretch et que l'on veux faire à la fois une écriture et une lecture dans un même processus.
La bonne nouvelle c'est que cela marchera de base dans la future version de Debian 
Au sujet de la question 1 je n'ai pas le courage de chercher quel changement précis dans les sources fait que cela fonctionne maintenant. Tant pis
Bons bricolages !