lesto:
che io sappia il reset non ha un pin, ma nel caso lo abbia allora sì, va bene.
Certo che ce l'ha 
Ho visto che ci sono 2 pin TX e 2 pin RX (una coppia disposta sul lato lungo dell'arduino mini e l'altra sul lato corto (di fianco ai pin di alimentazione)... posso usarle indifferentemente gli uni e gli altri?
dipende. Se dallo schema elettrico vedi che sono gli stessi pin portati agli stessi PIN dell'atmega (pin 0 e 1) allora è indifferente, altrimenti devi collegarti ai pin 0 e 1.
Non conosco lo schema ma essendo basato su un 328, questo ha solo 1 seriale per cui il dubbio non si pone