Enquanto a comunicação serial estiver ligada (Serial.begin) haverá erros de comunicação caso ocorra movimento no PIR?
Muito provavelmente diria que 99% de certeza que haverá, ja que se estas a enviar dados caso algo interfira isso sera adicionado ao que estas a transmitir fazendo uma grande "salada" no sinal transmitido.Nao sei a dimensao do teu projecto mas nao podes evitar a UART e usar outro qualquer?
Podes sempre usar um port-expander I2C para aumentar os GPIO do teu micro